Promover o acesso ao tratamento em saúde de maneira irrestrita e lidar ao mesmo tempo com um orçamento limitado é uma das árduas tarefas do Programa de Medicamentos Excepcionais do Ministério da Saúde. Em 2008, a previsão é de que o programa custe R$ 2,3 bilhões ao orçamento do ministério, enquanto em 2003 ele onerava em R$ 516 milhões. Neste ano, a área de Assistência Farmacêutica do ministério, responsável pelo financiamento de medicamentos da atenção básica, estratégicos e excepcionais terá um orçamento de R$ 5,2 bilhões, isto significa que o programa de excepcionais é responsável por 44% dos gastos com medicamentos.